虽然海带绿豆排骨汤的功效十分显著，但是我们也不可忽视它的副作用。虽然适量食用海带可以缓解痤疮肿痛，但吃得过量也不好。海带中含有比较丰富的碘，如果食用海带过多，其中所含的过量碘和碘化物会由皮脂腺排泄出来，刺激毛孔，长期可能导致毛囊周围过度角化，引起痤疮反复发作，久治不愈。所以不能在排骨汤里面放过多海带。
而绿豆是寒凉之物，有解暑解毒之功效，但是虚寒体质不可以多用。绿豆的解毒作用源于绿豆蛋白等成分与有机磷、重金属结合成的沉淀物。然而，这些解毒成分也会与药物的相关成分发生反应，从而降低药效。所以正在服用各类药物，特别是中药汤剂的人更要慎喝绿豆汤。