缺碘症的症状表现与缺碘的程度、持续时间以及患病的年龄有关。如果是胎儿期缺碘，就会导致胎儿发育不良，对胎儿脑和神经发育受影响，严重的话会引发克汀病、亚克汀病，出生后表现为身材矮小、粘液水肿，智力下降，单纯性耳聋，斜视，步态共济失调等;如果是新生儿缺碘，就会导致新生儿出现甲状腺功能低下;如果是儿童和青春期缺碘，则会引发地方性甲状腺肿、地方性甲状腺功能减低症以及单纯性聋哑。如果要是成人期缺碘会出现食欲减退，无力、易疲劳，体能下降等症状，如果妇女严重缺碘，会造成女性有月经异常、不孕、流产、早产、死亡和胎儿先天畸形等。
而要是长期的缺碘则可出现亚临床型甲状腺功能减低症，最主要的症状表现为轻度智能迟缓，或轻度听力障碍，还会伴有体格生长落后。