新生儿刚生下来看看性器官就知道性别了，但是也有分不清是男是女的所谓“半阴半阳”的情况。这时该怎么办呢？有经验的医生在某种程度上都能予以区别，但并不是都能够根据性器官区别。这时可把新生儿的细胞做组织培养，检查一下其染色体就可以确定。要尽量用这种方法在报户口之前检查出准确的性别。在户口上留下了性别变化的记录，孩子以后是会发现的。在已知的半阴半阳者中，有“女性半阴半阳”的，实际上是女性，但是阴蒂很大，看上去像个男孩子似的，没有阴囊，尿道好像是阴茎的根部，这与男孩子同时患有单丸症和尿道下裂症时的情形很相似。可是作为女性特征的卵巢、子宫、阴道都有。这是由于先天缺乏制造副肾皮质激素的酶，周围的雄性激素过剩而使外阴部在胎内就男性化了。对这样的新生儿，只要经常使用副肾皮质激素，并对外生殖器进行手术，就能长成一个正常的女人。这种手术最好在孩子还不懂得自己是男是女的2岁以前进行。
也有并非先天性异常，而是由于母亲在妊娠初期为防止流产而注射雄性激素引起的“女性半阴半阳”。这也只需做手术即可。