性交是艾滋病最常见的传染方式。由于艾滋病病毒在患者或带病毒（隐性）的精液、阴道分泌物中都被发现，因此它可以通过性行为由男人传染给女人，由女人传染给男人，或由男人传染给男人。就通过性行为传染而言，危险性最高的是拥有多个性伴侣的男人或女人（同性恋或异性恋者），尤其是男同性恋者发病率最高。同性恋中的肛门性交（鸡奸）是传染AIDS的主要途径。AIDS的传染源是AIDS患者或携带HIV的无症状者，HIV虽然可以从病人血液、子宫颈分泌液、唾液、眼泪、乳汁、精液和尿液中分离出来，但是只证明了血液及精液有传播作用。目前已发现，精液中带有人类免疫性缺陷病毒的淋巴细胞，可通过直肠黏膜破损处，进入对方的血液循环或淋巴系统，把人类免疫性缺陷病毒传染给性伴侣即接受肛门性交者，致使AIDS在同性恋者中互相传播。