检查内分泌最好在月经来潮后的第3-5天，这一段时间属于卵泡早期，可以反应卵巢的功能状态。但对于月经长期不来潮而且又急于了解检查结果者，则随时可以检查，这个时间就默认为月经前的时间，其结果也就参照黄体期的检查结果。
之所以选择在月经第3-5天做性激素六项检查，是因为这时的激素水平是基础卵泡期，而月经第二天检查有所不妥，是由于有许多女性在月经第1-2天只有少量的阴道出血，这说明黄体期的激素水平没有明显下降，误差很大，而月经第3-5天是稳定的；不会有误差。
性激素六项的临床意义是通过测定性激素水平来了解女性内分泌功能和诊断与内分泌失调相关的疾病。常用的性激素六项即卵泡生成激素(FSH)，黄体生成激素(LH)，雌二醇(E2)，孕酮(P)，睾酮(T)，催乳激素(PRL)，基本满足了临床医生对内分泌失调与否的筛查和对生理功能的一般性了。