小柴胡汤为三焦枢杻之剂，少阳首方，外可治表，内可治脏，中可和半表半里。
1、本方主治少阳病证。以往来寒热，胸胁苦满，苔白，脉弦为证治要点。因柴胡升散，苓、夏性燥，故对阴虚血少者忌用。
2、若胸中烦而不呕，为热聚于胸，去半夏、人参，加瓜蒌以清热理气宽胸;渴者，是热伤津液，去半夏，加天花粉以生津止渴;腹中痛，是肝气乘脾，宜去黄芩，加芍药以柔肝缓急止痛;胁下痞鞭，是气滞痰郁，去大枣，加牡蛎以软坚散结;心下悸，小便不利，是水气凌心，宜去黄芩，加茯苓以淡渗利水;不渴，外有微热，是表邪仍在，宜去人参，加桂枝以解表;咳者，是素有肺寒留饮，宜去人参、大枣、生姜，加五味子、干姜以温肺止咳。
3、常用于感冒、流行性感冒、疟疾、慢性肝炎、肝硬化、急慢性胆囊炎、胆结石、急性胰腺炎、胸膜炎、淋巴腺炎、中耳炎、产褥热、急性乳腺炎、睾丸炎、胆汁返流性胃炎、胃溃疡等属少阳证者。