与其他类型肝炎相比，自身免疫性肝炎的预后较好，经过治疗有80%-90%的患者能存活10年，治疗的成功有赖于恰当地选择适应证、选择适当的治疗方案、疗程足够、及时处理并发症、定期检查。
1、恰当地选择适应证：针对不同治疗方法选择恰当的适应证是保证治疗效果、避免严重并发症的重要措施，应根据患者的病情及自身体质筛选合适的适应证。
2、选择合适治疗方案：选择合适的治疗方案是保证疗效的前提，不恰当的治疗方法严重影响病情恢复，治疗时需结合患者具体情况实施个体化治疗，选择合适的治疗方案。
3、疗程足够：自身免疫性肝炎治疗是个长期过程，应保证足够的疗程，不能坚持规范的治疗不仅达不到治疗效果，还可能引发病情反弹、恶化。
4、及时处理并发症：治疗期间如出现并发症，应及时采取有效措施阻止病情发展。
5、定期检查：不管是在治疗期间还是停药后，患者都应定期进行肝功能、B超等检查，观察肝脏的大小、有无脾脏的增厚，有无门静脉、脾静脉的增厚，以便医生及时发现病情的变化调整治疗方案。