一、肛门指诊
二、X线检查
1、腹部平片；
2、钡餐检查；
3、空气灌肠检查。
三、内镜检查
胃部分切除术后，胃空肠吻合口套叠可行纤维胃镜检查确诊。内镜可见充血水肿的小肠黏膜经吻合口向胃内突出。慢性小肠型套叠可采用纤维小肠镜来诊断，同时可取活检，有助于确定病理性质。累及结肠的套叠根据情况可选用直肠镜、乙状结肠镜或纤维结肠镜检查诊断。
四、超声检查
肠套叠声像主要为肠梗阻、套叠局部和肠壁缺血等特征表现。
CT可依据套叠内的密度，或CT值测定判断套叠的性质，如脂肪密度肿块多为脂肪瘤水样密度的阑尾多为黏液囊肿。如不规则的实性肿块多为恶性肿瘤等，均可引起套叠。
五、MRI 应用
表现为套叠近端肠管明显扩张、积气及气-液平面，套叠肠管区可见同心圆状长/短T1长/等T2软组织肿块信号。腹腔内可有少量游离液体呈长T1长T2信号。
六、其他
采用腹腔血管造影诊断肠套叠，用核素99Tc诊断本症，目前尚未广泛应用。