子宫内膜薄的的治疗方法有西药、手术和传统中医疗法。
1、西药疗法：单纯内分泌因素造成的子宫内膜薄，临床上可以用激素调整，适量的雌激素、孕激素可以在一定程度上增加子宫内膜的厚度，改善子宫内膜薄的症状，然而激素的危害很大，长期使用会导致器官衰竭，免疫能力急剧下降等。
2、手术疗法：手术疗法一般适用于由内膜粘连和损伤引起的子宫内膜薄，只能在宫腹腔镜下进行冷器械处理后，再做防粘连处理，严重的还要进行内膜移植。
3、传统中医法：子宫内膜薄在中医理论中是多属于肾虚、气血两虚，以致气血不能濡养，冲任失调。可以通过中药治疗，补气养血、益肾健脾，使子宫内膜逐渐增厚。但传统中药一般见效较慢。