1、烹调黄豆芽切不可加碱，要加少量食醋，这样才能保持维生素B不减少。
2、烹调过程要迅速，或用油急速快炒，或用沸水略氽后立刻取出调味食用。
3、黄豆芽性寒，肾炎，肾功能衰竭，慢性腹泻及脾胃虚寒者不宜食用，否则加重病情。
4、加热豆芽时一定要注意掌握好时间，八成熟即可。没熟透的豆芽往往带点涩味，加了醋即能去除涩味，有能保持豆芽爽脆鲜嫩。
5、勿食无根豆芽，因无根豆芽在生长过程中喷洒了除草剂，而除草剂一般都有致癌、致畸、致突变的作用。
6、对黄豆芽过敏的人不宜食用。黄豆芽也有可能成为过敏原的，如果是对黄豆芽过敏的话，食用黄豆芽就可能造成皮肤红肿、经常性腹泻、消化不良、头痛、咽喉疼痛、哮喘等过敏症状了，所以此类人群也要避免食用黄豆芽。