微波炉蒸南瓜虽然没有直接火上蒸锅蒸出来的效果好，但是两者的营养价值是差不多。微波炉蒸南瓜的营养价值同样也很高，因为南瓜采取蒸的方式是最能保证其营养成分不流失的。俗话说“药补不如食补”，近两年，随著国内外专家对蔬菜的进一步研究，发现南瓜不仅营养丰富，而且长期食用还具有保健和防病治病的功能。南瓜中含有丰富的胡萝卜素和维生素C，可以健脾，预防胃炎，防治夜盲症，护肝，使皮肤变得细嫩，并有中和致癌物质的作用。
除此之外，南瓜这一黄色果蔬中的维生素A和D特别丰富。维生素A能保护胃肠黏膜，防止胃炎、胃溃疡等疾患发生；维生素D则有促进钙、磷两种矿物元素吸收的作用。所以适量吃蒸南瓜能收到壮骨强筋之功，对于儿童佝偻病、青少年近视、中老年骨质疏松症等常见病有一定预防作用。
一般微波炉蒸南瓜采用的是老南瓜，相较嫩南瓜，老南瓜中钙、铁、胡萝卜素含量较高。南瓜中还有一种“钴”的成分，食用后有补血作用，清代名医陈修园就曾说：“南瓜为补血之妙品”。蒸南瓜中的南瓜含有人体所需的多种氨基酸，其中赖氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸等含量较高。蒸南瓜中的南瓜多糖，是一种非特异性免疫增强剂，能提高机体的免疫功能。