方便面是经过精制的面制食品，因此这种“过精”的食品含有卵磷脂、蛋白质、糖分、钙质、维生素A、维生素C、维生素E及B族维生素等八大营养素含量出奇地低，不能满足人体营养需求，长期吃方便面的危害是有损大脑活动。方便面含有的纤维素也过少，患慢性便秘也是吃方便面的危害之一，粪便长期积藏在大肠，易诱发肠癌。如果油炸的方便面没有经过泡发就直接干吃，其香脆可口确实诱人，但容易感觉口干发热，这时候火气在体内积聚，造成上火。方便的其它组成部分也有危害。如汤料调味包，主要是由味精和视频添加剂组成，长期食用会使人味觉迟钝，影响正常食欲。
尽管现在很多方便面都号称不是油炸的，但多少都会含有食用油，因此，放置的时间一长，方便面之中的油脂就会被空气氧化分解，生成有毒的醛类过氧化物。吃了这种油已变质的方便面，会给你带来意想不到的麻烦，比如引起头晕、头痛、发热、呕吐、腹泻等中毒现象。方便面在制作过程中过程中会产生一些有害物质。所有淀粉类食品在高温烹调（超过120℃）中都会产生丙烯酰胺这种致癌物，进过高温油炸而成的方便面也会含有丙烯酰胺。